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随着新冠病毒席卷全球，一条“台湾节目追溯新冠病毒源头，然后追到美国去了”的视频火了。节目中，有关嘉宾判断新冠病毒源头可能在美国的主要依据，正是前不久中国科学院西双版纳热带植物园、华南农业大学和北京脑科中心在ChinaXiv论文预印本网站上联合发布的一篇论文。 这篇引起台湾节目关注的论文说了啥？依据这篇论文，能否得出新冠病毒的源头在美国的结论？为此，记者特别邀请了兰州大学研究员赵序茅，为大家解读这篇论文中的相关信息。 病毒溯源：找啊找啊找“爷爷” 此次台湾节目之所以将新冠病毒源头追到美国去，一个重要理由是：在美国发现了单倍型H38的病毒样品。 什么是单倍型？从事气候变化生态学和保护生物学研究的赵序茅打了个比方：正如一个公司由多个职责不同的部门相互协作才能有效运转，病毒的特性也由很多基因决定，单个基因不能发挥作用，这一个个单倍型就好比一个个独立的部门。简单说，单倍型就是决定同一性状的基因组合。 这篇由中国科学院西双版纳热带植物园郁文彬等人合作的论文，收集了覆盖四大洲12个国家的93个新型冠状病毒样本的基因组数据（截至2月12日），并发现这93个病毒样本包含58种单倍型。 而且，论文中，单倍型演化关系显示，单倍型H13和H38是比较“古老的”单倍型，通过一个中间载体——mv1（可能是祖先单倍型，也可能是来自中间宿主或“零号病人”）与蝙蝠冠状病毒RaTG13关联，并通过单倍型H3衍生出单倍型H1。 根据这一单倍型演化关系，如果我们简单梳理，可以得到下面的两组示意图： mv1H13H3H1 mv1H38H3H1 这意味着什么？“最开始的是单倍型mv1。”根据赵序茅的解读，新冠病毒就像一个家族企业， H38和H13是病毒的第一代创始人，我们可以称之为爷爷辈单倍型； 之后的H3是病毒的第二代掌门人，我们可以称之为父辈单倍型； 而H3衍生出孙子辈H1，则是病毒的第三代掌门人。正是这个孙子辈H1让病毒空前强大，如日中天。 H1又衍生出曾孙辈的H56和mv2，作为第四代掌门人。 按照正常逻辑，爷爷辈的单倍型所在地就是病毒的祖籍。但论文研究团队发现，与华南海鲜市场有关联的患者，其样品单倍型都是孙子辈的H1及其子孙后代（也就是单倍型H2、H8－H12），仅有的一份武汉样品单倍型H3，也就是父辈单倍型H3，还与华南海鲜市场无关。 据此，并结合病患发病时间记录和种群扩张时间，论文研究团队推断：华南海鲜市场的新型冠状病毒是从其它地方传入进来，在市场中发生快速传播蔓延到市场之外。换句话说，该论文认为，华南海鲜市场不是病毒发源地。 疑问来了：源头在不在美国？ 研究到此并未结束。顺藤摸瓜，论文研究团队对两个“古老的”单倍型，即爷爷辈单倍型H13和H38的病毒样品又溯源，发现他们分别是来自深圳的病患（广东首例）和美国华盛顿州的病患（美国首例）。其中，美国的这个病患就是台湾节目中提到的单倍型H38的病毒样品。 既然爷爷辈的单倍型是在深圳和美国发现的，那么这是不是说明深圳和美国就是新冠病毒的发源地呢？ 事情没有想象的那么简单。关于判断新冠病毒来源，上海市新冠肺炎医疗救治专家组组长、复旦大学附属华山医院感染科主任张文宏在接受有关媒体采访时，曾说了两点： 一、这个病毒出现的时间点，哪里最先出现的，要追究这个时间的先后； 二、要寻找它在进化树上面的位置，后面基因的进化是在前面的基础上。 而追踪爷爷辈单倍型H13和H38患者的感染时间和活动轨迹，论文研究团队发现，两位患者的旅行记录显示，他们应该都是2019年12月底至2020年1月初在武汉活动期间被感染的。换句话说，论文研究团队认为两个爷爷辈单倍型H13和H38来自武汉。 “此外，台湾节目认为在美国的病毒中包含5个单倍型群，所以美国是病毒起源。这说明美国感染病毒的途径比较多，比如武汉、澳大利亚、深圳等。”赵序茅分析。 因此，基于这篇论文我们无法得出新冠病毒源头在美国的结论。 “根据基因组分析，新冠病毒的源头并不在华南海鲜市场。其源头究竟在哪，还需要相关研究者的继续追踪，但根据目前的相关研究，应该还在武汉。”赵序茅称。 专家解读：美国流感中有些人可能死于新冠肺炎？ 既然如此，现有武汉样本，为何没检测到“爷爷辈”单倍型？论文研究团队认为，这可能是因为现有样品主要采自几家定点医院，而且样品采集时间局限于2019年12月24日和2020年1月5日。 按照赵序茅的话说，武汉病毒样品采集时间较晚。随着病毒的推陈出新，其单倍型不断壮大，多样性不断丰富。“武汉因为采集时间较晚，此时爷爷辈的单倍型很有可能已经被父辈、孙子辈的单倍型替换了。” 事实上，关于这项研究的局限性，论文作者郁文彬也曾在接受有关采访时坦陈，这项研究有个不足，那就是93个样本中，武汉样本主要是早期的，如果有更多武汉样本进行基因组测序的话，可能在溯源方面可以找到更多的证据，比如说找到H13和H38单倍型，可能可以帮助找到病毒来源。 “病毒是不断更新换代的，根据这篇文章的研究报道，美国携带H38单倍型的病毒患者有过武汉期间的旅行史和武汉地区密不可分。且病毒确诊病例在美国的基数比较小，病毒扩散得比较慢，因此病毒更新换代也慢，因此找到爷爷辈的单倍型也不奇怪。最关键的问题是样本量太少只有93份病毒样品，且样品采集时间较晚，这是影响分析结果最重要的因素。”赵序茅如是分析。 鉴于此，论文研究团队提出，如果能在武汉其它医院早期的病患检测到这两种单倍型，将对于寻找病毒来源非常有帮助。 对于武汉为何会成为疫情主要爆发地，而较早出现爷爷辈单倍型的广东则相对较好？赵序茅分析：一来流落到广东的病毒量较少，二来地方发现后采取了相对严格的应对措施。反观武汉，病毒种群大，前期没有及时有效采取更严厉的举措，这就导致感染的人越来越多。 除了这篇中科院的论文外，台湾节目中有关嘉宾将新冠病毒源头追到美国的另一依据，是一则“美国流感死亡1.2万人，其中有很多可能死于新冠肺炎”的相关消息。 对此，赵序茅认为，这种没有数据依据的推测可信度不够。他说，虽然新冠肺炎和流感的临床症状有一定的相似性，且两种都属于RNA病毒。但是这是两种不同的病毒，没有亲缘关系，且流感和新冠肺炎的检测方式也不同。 “人类和流感病毒打交道的历史悠久，对流感的检测远远比新冠病毒成熟，只需要一个简单的流感快速核酸扩增试验就可以判断。因此，误判的可能性不大。”赵序茅称。 事实上，就在当地时间28日，世卫组织专家表示，目前尚无法确定新冠病毒源头。世卫组织卫生紧急项目技术主管科霍夫表示，要确定导致人感染新冠肺炎的中间宿主动物，还有很多要做的工作。目前还没有确切的答案，但正在积极研究。
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發表於 2020-3-4 14:10:09
狗仔卡
